В структуру Вологодского филиала РАНХиГС включены обособленные структурные подразделения: учебный отдел; методический отдел; отел кадров; бухгалтерия; библиотека; кафедры: экономики и финансов, управления персоналом, общественных дисциплин.
Учебный процесс обеспечивают 16 штатных преподавателей, из которых 13 – доктора и кандидаты наук. К учебному процессу привлекаются специалисты Северо-Западного института РАНХиГС (г. Санкт-Петербург)и ведущие специалисты-практики органов государственной власти и местного самоуправления, крупнейших предприятий области.
Использование дистанционных технологий дало возможность Вологодскому филиалу приглашать сторонних преподавателей и консультантов для проведения занятий по узкоспециализированной тематике, используя системы видеоконференцсвязи и интерактивного оборудования.
Вологодский филиал РАНХиГС располагает тремя компьютерными классами с выходом в Интернет. Для ограничения доступа и безопасности компьютерная сеть разделена на пять отдельных локальных сетей. В учебном процессе используется 57 ПК, установлены три Интернет-сервера. Филиал имеет высокоскоростной доступ к информационным ресурсам. В процессе обучения преподавателями учебного заведения активно используется система дистанционного тестирования и контроля знаний с использованием сети Интернет. Вход осуществляется через соответствующий раздел сайта филиала с обязательной регистрацией студента или слушателя. Студенты и слушатели филиала имеют возможность пользоваться услугами компьютерных классов для самостоятельной подготовки к занятиям.